Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms