Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GscQ02591 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms