Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms