Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
PrkcqQ02111 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms