Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms