Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms