Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms