Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms