Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde4dQ01063 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde4dQ01063 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms