Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb2Q00977 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms