Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms