Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms