Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps3aP97351 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps3aP97351 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms