Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp1P97350 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms