Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mesp1P97309 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms