Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubg1P83887 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms