Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms