Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms