Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms