Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp3P70281 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms