Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms