Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54lP70270 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms