Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms