Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms