Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms