Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbdP63072 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbdP63072 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
UbdP63072 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UbdP63072 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms