Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms