Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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