Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copz1P61924 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms