Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms