Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sem1P60897 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sem1P60897 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sem1P60897 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sem1P60897 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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