Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3eP60229 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms