Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Senp1P59110 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms