Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd4P58467 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms