Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms