Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn18P56857 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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