Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace1P56818 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bace1P56818 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms