Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1P56716 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms