Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms