Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms