Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtskP55097 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms