Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms