Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pms2P54279 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms