Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms