Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TspoP50637 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TspoP50637 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TspoP50637 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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TspoP50637 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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TspoP50637 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TspoP50637 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TspoP50637 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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