Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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