Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms