Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtpreP49446 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtpreP49446 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms