Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms