Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms